Existen pocos ERP preparados para gestionar la fabricación por proyectos. Lo que lleva a la que la mayoría de los ERP no incluyan funcionalidades para estas empresas. Normalmente, la mayoría de los son estándar y se centran en el área administrativa y CRM. Algo insuficiente cuando hablamos de organizaciones de fabricación.
La fabricación por proyectos requiere herramientas que gestionen las áreas de producción, como por ejemplo, órdenes de trabajo que permitan definir planificar todos los pasos de la logística y del consumo de materiales.